击败了汪达尔·萨维奇之后，鹰侠和鹰女离开了团队。时间之主理事会已经被摧毁，传奇小队决定肩负起保护历史的责任。然而美国正义协会领袖时侠雷克斯.泰勒（帕特里克·J·亚当斯饰）突然出现，警告传奇小队不要登上乘波号，否则他们都会死亡。最终传奇小队无视了雷克斯.泰勒的警告，时间穿越回了1942年的纽约。
历史学家内特·海伍德博士（尼克·扎诺饰）找到市长即绿箭侠奥利弗·奎恩（斯蒂芬·阿梅尔饰），需要其帮助寻找失踪的乘波号及上面的人员。二人在大西洋水域海底找到了沉没的乘波号以及船上的唯一幸存人员但是处于静止状态的米克·罗里（多米尼克·珀塞尔饰）。醒来后的米克告诉他们，达米恩·达克（尼尔·麦克唐纳饰）在1942年与纳粹合作制造了一颗原子弹并向纽约发射，船长里普·亨特（亚瑟·达维尔饰）决定将传奇小队成员时间分散到整个历史时期，而他自己却留在乘波号上，阻挡达克的原子弹路线，拯救了纽约免遭灭顶之灾。米克由于在行动中受伤被设置进入静止状态，所以没有像其他队友一样被分散转移。但里普却失踪了，米克不知道队友们都被时间分散去了哪里，内特想办法解救出了传奇小队成员并将他们重新聚集起来，但群龙无首，最终由莎拉·兰斯（凯蒂·洛茨饰）暂代船长之职。
之后，传奇小队与1942年的美国正义协会相遇，美国正义协会成员雌狐阿玛雅·吉韦（麦茜·理查德森·塞勒斯饰）也加入了团队。而反派马尔科姆·梅林（约翰·巴洛曼饰）与达米恩·达克、逆闪电艾尔伯德·斯旺（马特·莱斯切尔饰）、寒冷队长莱纳德·史纳特（温特沃斯·米勒饰）则组成了末日军团，妄图利用命运之矛改变现实。传奇小队必须采取行动去阻止末日军团抢夺命运之矛